10 दिसंबर 2025 को नागरिक उड्डयन महानिदेशालय (DGCA) ने IndiGo के उड़ान कार्यक्रम में 10% कटौती का आदेश दिया। 9 दिसंबर को 5% कटौती के आदेश के बाद इसे बढ़ाया गया, क्योंकि एयरलाइन का उड़ान-प्रबंधन संकट नौवें दिन भी जारी रहा। 60% से अधिक घरेलू बाजार हिस्सेदारी वाली IndiGo ने दिसंबर के पहले दस दिनों में लगभग 4,500 उड़ानें रद्द कीं। संकट की मुख्य वजह 1 नवंबर 2025 से लागू नए FDTL नियम थे, जिनमें पायलटों के लिए 48 घंटे (पहले 36) का साप्ताहिक विश्राम और प्रति पायलट प्रति सप्ताह केवल दो रात्रि लैंडिंग की शर्त रखी गई थी। IndiGo ने स्वीकार किया कि उसने थकान से जुड़े नए नियमों के तहत क्रू की जरूरत का गलत आकलन किया। DGCA ने IndiGo को शाम 5 बजे तक संशोधित परिचालन कार्यक्रम प्रस्तुत करने का निर्देश दिया। नागरिक उड्डयन मंत्रालय ने प्रभावित मार्गों पर हवाई किराए की सीमा तय की और सभी लंबित यात्री धनवापसी निपटाने का आदेश दिया। 17 जनवरी 2026 को DGCA ने इंडिगो पर ₹22.20 करोड़ का जुर्माना लगाया।